本书从基本的生物信息学相关的计算机的使用，到利用生物信息学方法去分析和探讨一个实际的生物学问题，总共设计十三个大实验，包括linux入门及操、编程基础及简单应用、NCBI网站使用、EBI网站使用、序列比对分析、进化分析、转录组组装、转录组分析、基因组组装、基因组注释、基因预测、比较基因组、综合实验，每个实验中又包括了当前为流行和应用广的相关软件。其中基础部分适合本科生教学，而提高部分适合研究生教学。本书的所有实验基本包含了现阶段核酸序列分析方面的主要软件和应用。