玛丽从小随父母在印度生活，后因父母死于瘟疫被送回英国的舅舅家寄养。那是个僻静、空旷、荒芜的旧宅院，舅舅因痛失爱妻终日郁郁寡欢，荒于家政。玛丽听说有个秘密的花园被舅舅锁了整整十年，从未有人涉足。因好奇心驱使，玛丽找到被埋已久的钥匙，偷偷打开了花园的门……玛丽还听到宅院里有奇怪的哭声，循声而去，发现舅舅还有个瘫痪在床的儿子，但舅舅因为怕看见孩子想起难产而死的妻子，终日把他关在屋里。玛丽偷偷把表弟带入秘密花园，大自然的力量让表弟重新站立了起来，最终博得了他父亲的爱。