《神秘岛》叙述了在美国南北战争时期，5个被围困在南军城中的北方人趁着偶然的机会用氢气球逃脱，意外降落在一个荒岛上并克服了种种困难生存下来的故事。荒岛上什么都没有，但5个落难人并没有灰心失望，而是团结互助，以集体的智慧和劳动，克服了重重困难。他们从赤手空拳一直到制造出陶器、玻璃、风磨、电报机……过上了幸福的生活。他们不仅在一次意外中驯化了一只猿猴杰普，还挽救了在附近另一座孤岛上独居了12年而失去理智的罪犯艾尔通，使他恢复了人性，成为他们忠实的伙伴。他们还凭借智慧与神秘人的帮助打败了海盗。最后，他们登上了格兰特船长的儿子罗伯特指挥的“邓肯号”，重新回到了祖国的怀抱。