本文构建了一个由村镇物流核心要素Agent、支持要素Agent和环境要素Agent构成的复杂适应性系统，以及由“三要素、四生态流、双层圈”形成的村镇物流生态系统架构。由此展开三方面研究：(1)基于生态学、全要素生产率理论以及演化博弈理论，探讨“链环―功能”主导村镇物流生态系统发展模式，如何升级到“平台―功能”主导模式。(2)研究村镇物流生态系统内自组织演变，系统“生态流”影响系统时间与空间重构。(3)对环境子系统内部参量因素进行分解与筛选，探索“耦合―协同”动力系统及内部子系统之间的关系，以及如何调整参量使系统实现最优。

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